Setelah selesai dibangun nanti, kehadiran Stasiun Manggarai menjadi stasiun sentral pertama di Indonesia diharapkan mampu meningkatkan pelayanan jasa angkutan penumpang KRL Jabodetabek dan KA jarak jauh dari dan ke Provinsi DKI Jakarta.
Hal ini dilatarbelakangi dengan hasil riset Badan Penelitian dan Pengembangan (Balitbang), Kementerian Perhubungan, yang telah memprediksi potensi pergerakan pemudik di masa lebaran tahun ini yang mencapai 85 juta orang.